根据农业部、中国农科院、江苏省科技厅和江苏省农林厅“十一五”规划的总体要求，为实现江苏省家禽科学研究所的跨越式发展，合理制定了我所第十一个五年发展规划. 
    “十一五”规划首先实事求是的分析了我所的现实基础和所面临的形势，指出我所存在的困难与问题，在此基础上强化优势学科，推进一般学科，提出了“十一五”发展规划总体思路与发展目标，确定了“十一五”的主要任务。主要任务包括以下六个方面: 
     一是能力建设，主要指家禽资源保护及遗传育种研究平台、家禽疫病防制研究平台和家禽业信息网络平台三大科研平台建设； 
     二是公益研究，主要是以家禽资源保护、评价、鉴定与遗传育种技术研究；重大禽病综合防制技术研究、家禽安全；生态养殖关键技术研究和家禽业信息网络应用技术研究四个领域开展； 
     三是公益服务，服务的重点在加快家禽遗传育种科技成果转化、推动家禽安全生产技术服务、开展家禽资源共享与产品质量监测服务和提升家禽业信息服务水平四个方面； 
     四是加快经济发展，通过调整产业结构，发展优势产业和采取有力措施等手段，走出经济困境； 
     五是加强人才队伍建设，通过用好现有高层次人才，培养青年骨干，引进高级人才，建立激励机制等一系列手段，以保证我所科研力量的连续性和开拓性； 
      六是深化内部体制改革，人事制度改革、分配制度改革和推进蚕种场改制的顺利开展势必将充分调动积极性，增强活力。 
      主要任务的完成与否，离不开有力措施的保证。而以优化内部运行机制、加强内部管理、营造创新环境、加大科研投入和加强思想政治工作一系列措施的展开，将为实现我所“十一五”发展规划的顺利实施提供强有力的保障。 
      我所“十一五”发展规划制定了十八个重点项目，它们包括：江苏省家禽重大疫病防制研究中心建设、地方禽种资源备份基因库的建设、江苏省家禽科学研究所育种场扩建、中国家禽业信息网络平台建设、无特定病原体鸡群的建立与研究、禽产品加工科技开发研究中心建设、江苏省家禽种质资源基因库监测系统的建设、优质黄羽肉鸡规模化生产模式的研究、江苏省家禽遗传育种重点实验室改建、优质草鸡蛋用品种的选育研究、水禽副黏病毒灭活疫苗的研制、家禽品种质量及产品品质检测条件建设、家禽生产性能测定及禽蛋肉品质检测技术的研究、家禽重大疫病流行病学调查与综合防治技术研究、家禽资源评价体系的建设、优质鸡新品种选育及安全禽产品高效生产技术研究、水禽的营养需要和饲料配方的研究和家禽行业电子商务与远程教育培训平台建设。