资源保护与评价研究室主要以鸡品种资源收集、保护与评价研究为方向，重点开展特色家禽种质资源普查、种质资源收集保存，保种方法评价与保种效果监测，品种遗传进化和分子标签，种质资源高效精准鉴定，品种功能性基因的挖掘，血缘更新理论与实践，发掘携带优异基因种质资源材料，定向改良和创制优质、高产、高效、健康、抗病、抗逆等优异性状新种质等方面的研究。

学科团队现有技术人员10人，其中研究员3人、副研究员2人，博（硕）士研究生5人；第三次全国畜禽遗传资源普查鸡普查专业组专家1人，江苏省“六大人才高峰”和“333工程”高层次培养对象1人。

拥有国家地方鸡种基因库（江苏）、农业农村部畜禽资源（家禽）评价利用重点实验室等平台，活体保存珍稀、濒危、特色地方鸡种30多个，建成鸡DNA资源库，保存遗传物质3万余份。

近年来，承担国家自然科学基金、国家重点研发计划（子课题）、农业农村部物种资源保护、江苏省种业振兴“揭榜挂帅”、江苏省重点研发计划（现代农业）、江苏省自然科学基金等项目20多项，授权发明、软著专利30余项，制定国家、地方标准10多个，在《畜牧兽医学报》、《Communications Biology》、《BMC Genomics》等期刊发表研究论文60多篇，出版专著5部，参与6个国家级新品种（配套系）培育。获得部省、市各级奖项5个。在鸡遗传资源保护、评价与利用方向形成了鲜明特色和独特优势。